Wie One Piece volgt, weet dat Luffy in staat is om de Conqueror's Haki te gebruiken om zo tegenstanders helemaal te verstommen. Het werkt niet bij iedereen, maar vooral kleiner tuig zal onder de indruk zijn van deze kracht en kan dus op deze manier net iets eenvoudiger – en zonder weerstand te bieden – in de pan gehakt worden. Dit systeem zat nog niet in de eerste game, maar wordt dus wel in One Piece: Pirate Warriors 2 gestoken. Ook Zoro en Enel zullen van hun eigen versie van Haki gebruik kunnen maken. Verder zullen de personages ook een Style Change kunnen ondergaan, waarbij men bijvoorbeeld plots heel wat sterker wordt of veel sneller kan bewegen.
