Anarchy Reigns wordt niet enkel een spel waarbij je op elkaars smoel kan kloppen tot iedereen erbij neervalt, want er zit ook een verhaallijn doorheen het spel. Om duidelijk te maken dat het dus meer is dan wat geklop, heeft Platinum Games 2 trailers vrijgegeven waaruit blijkt dat je 2 verschillende kanten op kan met het verhaal, de zwarte zijde en de witte zijde. Bij de zwarte zijde krijg je te maken met Jack uit Madworld, terwijl de witte zijde je Leo voorschotelt. De missies veranderen wat en de cutscenes zijn ook anders, dus de levensduur van het spel wordt hiermee wel wat uitgerekt.
